RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6Q795 121 aa8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 PRORYQ9H606 182 aa8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 APOC4P55056 127 aa8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 PDZD2O15018 2839 aa8.69□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.68□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.68□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.68□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 COX7BP24311 80 aa8.68□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 RMI2Q96E14 147 aa8.68□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.67□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM236CP0DP71 79 aa8.67□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 FHL2Q14192 279 aa8.67□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 C10orf25Q5T742 122 aa8.66□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.66□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.66□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 C4orf26Q17RF5 130 aa8.66□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.65□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 BPY2O14599 106 aa8.65□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 BRI3O95415 125 aa8.65□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8N814 137 aa8.65□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A087WZ39 114 aa8.65□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.65□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.65□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.64□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.63□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.63□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 IMUPQ9GZP8 106 aa8.63□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.63□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.62□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.62□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFS5O43920 106 aa8.62□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM258P61165 79 aa8.62□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.62□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 SVIPQ8NHG7 77 aa8.61□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.59□□□□□ -1.03
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.58□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6JHZ5 121 aa8.58□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.57□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8IZM0 81 aa8.57□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV1-51P01701 117 aa8.56□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZVQ6 151 aa8.56□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.55□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 H0Y9J4 135 aa8.54□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.54□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00575Q6W349 94 aa8.54□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZTC4 211 aa8.54□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.53□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 M0R2N4 97 aa8.53□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM104AQ969W3 186 aa8.53□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 PSPHP1O15172 72 aa8.52□□□□□ -1.04
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0G2JQZ4 141 aa8.52□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PNN7 141 aa8.52□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 SYCNQ0VAF6 134 aa8.52□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.51□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 LY6G6DO95868 133 aa8.51□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.51□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.5□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 MIFP14174 115 aa8.5□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZRU5 148 aa8.5□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.5□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.49□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC7Q8TAX7 377 aa8.49□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 LYRM9A8MSI8 78 aa8.48□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFC2O95298 119 aa8.48□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 CDK2AP2O75956 126 aa8.46□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.46□□□□□ -1.05
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.46□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 LELP1Q5T871 98 aa8.46□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 VWFP04275 2813 aa8.44□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.44□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2AP49459 152 aa8.44□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.44□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.44□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.44□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYGAP11844 174 aa8.43□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.43□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 MP68P56378 58 aa8.43□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 PRLHP81277 87 aa8.43□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 V9GYY9 64 aa8.43□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.42□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 M0R378 163 aa8.42□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 PDE6GP18545 87 aa8.42□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf137Q5JT78 98 aa8.41□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00208Q96KT6 92 aa8.41□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 X6R8D5 127 aa8.41□□□□□ -1.06
TRIOBP-211ENST00000492485 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.4□□□□□ -1.06
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