RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00483	Q53H64	154 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390		K7EMI3	77 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	TIMM17A	Q99595	171 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	BATF3	Q9NR55	127 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	RAB14	P61106	215 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	MOBP	Q13875	183 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	ADIRF	Q15847	76 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390		Q8NDZ9	215 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	AKAP14	Q86UN6	197 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SHOC2-205	ENST00000489390	G0S2	P27469	103 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	COX17	Q14061	63 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	PRY	O14603	147 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	GHRH	P01286	108 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	SPRR1A	P35321	89 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	C9orf92	A6NGG3	77 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	CFC1	P0CG37	223 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390		H3BRM9	83 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SHOC2-205	ENST00000489390	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	CST9L	Q9H4G1	147 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	ADCYAP1	P18509	176 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	PMVK	Q15126	192 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390	LIMD2	Q9BT23	127 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SHOC2-205	ENST00000489390		C9JQL5	133 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390		B5MCH6	92 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00158	P58513	81 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	NCR3	O14931	201 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	S100A12	P80511	92 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390		Q9BRP9	147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A0U1RRA0	63 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	PEA15	Q15121	130 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390		Q6ZRX8	168 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC01546	A6NGU7	62 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390		Q6Q795	121 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	ATP6V1G1	O75348	118 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	FA2H	Q7L5A8	372 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SHOC2-205	ENST00000489390	NDUFA6	P56556	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	C5orf52	A6NGY3	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	DDT	P30046	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	CD164	Q04900	197 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	SPRR1B	P22528	89 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	C1orf195	Q5TG92	126 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390		Q5XG85	94 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SHOC2-205	ENST00000489390	MT2A	P02795	61 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00846	Q9NV44	126 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00587	B1AMM8	73 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SHOC2-205	ENST00000489390	HERV-K104	P63124	156 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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