RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 SCXQ7RTU7 201 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 HIVEP2P31629 2446 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-3P60369 221 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 C16orf95Q9H693 158 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 C16orf74Q96GX8 76 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 LINC00167Q96N53 147 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZVQ6 151 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 BRK1Q8WUW1 75 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 A0A0U1RQV1 116 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZQT0 140 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 Q8N3U1 123 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 A0A096LPF7 62 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 DEFB130BP0DP73 79 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 DEFB130AP0DP74 79 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 KLKP1Q107X0 134 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.25□□□□□ -0.93
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NISCH-212ENST00000488380 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 LINC00575Q6W349 94 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 Q8IZM0 81 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.23□□□□□ -0.93
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NISCH-212ENST00000488380 EPM2AB3EWF7 344 aa9.21□□□□□ -0.93
NISCH-212ENST00000488380 MIFP14174 115 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 BCE1O60756 84 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 Q8NDZ9 215 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 GYPEP15421 78 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 J3QKU1 62 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 DEFB4AO15263 64 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 C6orf223Q8N319 242 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 NREPQ16612 68 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 NDUFC1O43677 76 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 CXCL6P80162 114 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 Q8N9L7 120 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 ATRQ13535 2644 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 MUC7Q8TAX7 377 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 X6R8D5 127 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-212ENST00000488380 BPY2O14599 106 aa9.15□□□□□ -0.94
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NISCH-212ENST00000488380 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
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NISCH-212ENST00000488380 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 DEFB135Q30KP9 77 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 C10orf25Q5T742 122 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 C1orf195Q5TG92 126 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 INAFM1C9JVW0 142 aa9.12□□□□□ -0.95
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NISCH-212ENST00000488380 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 REG3AQ06141 175 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 DIRC1Q969H9 104 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-212ENST00000488380 SPAG11BQ08648 103 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 V9GYY9 64 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 PRO0255Q9UI72 69 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
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NISCH-212ENST00000488380 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 PRYO14603 147 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 IGLV6-57P01721 117 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 F8WDY8 70 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 COX7BP24311 80 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 ESRGQ1W209 222 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 C3orf84H3BNL1 204 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 H3BQ85 93 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 HTN3P15516 51 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 SEC61GP60059 68 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-212ENST00000488380 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.03□□□□□ -0.96
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