RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487674.1

PRKCB-208, Transcript of protein kinase C beta, human

TSL 2

Gene PRKCB, Length 693 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCB-208	ENST00000487674		H3BRM9	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	ATP5L	O75964	103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	RAB5B	P61020	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	PMVK	Q15126	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCB-208	ENST00000487674	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	CTAG1A	P78358	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	PRLH	P81277	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	SCO1	O75880	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	VPREB1	P12018	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	S100P	P25815	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	PFN2	P35080	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	COX19	Q49B96	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674		M0R378	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	COX17	Q14061	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674		A0A096LNJ9	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	NDUFA6	P56556	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674		Q8NDZ9	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCB-208	ENST00000487674	HBD	P02042	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	S100A1	P23297	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	RHEB	Q15382	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	LINC00614	P0C842	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	LINC00158	P58513	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674		B5MCH6	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	PRY	O14603	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674		Q8NBF4	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674		A0A0U1RRA0	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	SPRR1A	P35321	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRKCB-208	ENST00000487674	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	NCR3	O14931	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	SPINK1	P00995	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	APOC3	P02656	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	DAND5	Q8N907	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	HERV-K104	P63124	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	S100A12	P80511	92 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	SVBP	Q8N300	66 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRKCB-208	ENST00000487674	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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