RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 J3QQQ9 107 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-240ENST00000484412 M0QXV9 152 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-240ENST00000484412 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-240ENST00000484412 PFN2P35080 140 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV7-43P04211 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 VPREB1P12018 145 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00158P58513 81 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00167Q96N53 147 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 C1orf137Q5JT78 98 aa8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM13P0DJ93 91 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01600Q96MT4 127 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 C5orf52A6NGY3 159 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 S100A6P06703 90 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2BP63146 152 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 C20orf202A1L168 122 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 KRTDAPP60985 99 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 MYCBP2O75592 4640 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF861PO60384 105 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 TIMM17BO60830 172 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 S100A2P29034 98 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 REG3GQ6UW15 175 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0J9YXY3 114 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 M0R378 163 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 NDUFC2O95298 119 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 DIRC1Q969H9 104 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 BCE1O60756 84 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 MT1HL1P0DM35 61 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP10-8P60410 259 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 Q8NDZ9 215 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0U1RRA0 63 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 H0Y9J4 135 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 LITAFQ99732 161 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR1AP35321 89 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZVH6 145 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF815PA8K554 130 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM126AQ9H061 195 aa8.42□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE10A6NGK3 116 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 SPANXCQ9NY87 97 aa8.4□□□□□ -1.06
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 PRYO14603 147 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV2D-28P01615 120 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 IFITM1P13164 125 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 DAND5Q8N907 189 aa8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV6-57P01721 117 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 COPS9Q8WXC6 57 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.38□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 ATOH7Q8N100 152 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.37□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.36□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.36□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM238C9JI98 176 aa8.36□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 S100A12P80511 92 aa8.36□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 DDTP30046 118 aa8.35□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 PCP2Q8IVA1 136 aa8.35□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 DLEU1O43261 78 aa8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2AP49459 152 aa8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.34□□□□□ -1.07
HDLBP-240ENST00000484412 SCGB1D1O95968 90 aa8.33□□□□□ -1.08
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