RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 PRYO14603 147 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 C4orf26Q17RF5 130 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 PMAIP1Q13794 54 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 C1orf137Q5JT78 98 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.54□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 CENPEQ02224 2701 aa9.54□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 CELA1Q9UNI1 258 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 A0A087WYN8 130 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 A0A096LNT2 108 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 C3orf84H3BNL1 204 aa9.52□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.52□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 LINC00846Q9NV44 126 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 MUC4Q99102 2169 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 Q9UF83 564 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 USP34Q70CQ2 3546 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 LIMD2Q9BT23 127 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 F8P00451 2351 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 VCANP13611 3396 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.48□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 X6R8D5 127 aa9.48□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 FAM229AH3BQW9 127 aa9.48□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 ESRGQ1W209 222 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 Q8N814 137 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 Q8N3U1 123 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 LAMA1P25391 3075 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-207ENST00000479054 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 PSPHP1O15172 72 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZRU5 148 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 PRR15LQ9BU68 103 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 EYSQ5T1H1 3165 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 AKAP13Q12802 2813 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 SPEGQ15772 3267 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 Q9BRP9 147 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 Q8NAQ8 132 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-207ENST00000479054 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.4□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.4□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 A8MTW9 85 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 C16orf90A8MZG2 172 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 C22orf24Q9Y442 160 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 K7ERS5 55 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 ITPR3Q14573 2671 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZVQ6 151 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 Q8N9L7 120 aa9.36□□□□□ -0.91
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NISCH-207ENST00000479054 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-207ENST00000479054 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.34□□□□□ -0.91
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NISCH-207ENST00000479054 K7EIL1 84 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZRP5 223 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 LINC00208Q96KT6 92 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 BCE1O60756 84 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 CXCL6P80162 114 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 PRLHP81277 87 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 LINC00575Q6W349 94 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-207ENST00000479054 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 A0A087WSZ3 146 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 LINC00167Q96N53 147 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 USP24Q9UPU5 2620 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-11P60412 298 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 COL6A3P12111 3177 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-3P60369 221 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 LITAFQ99732 161 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 ATRQ13535 2644 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 ZNF575Q86XF7 245 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 J3QL48 77 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 FRYQ5TBA9 3013 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GW54 56 aa9.21□□□□□ -0.94
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