RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C6orf223Q8N319 242 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 LECT2O14960 151 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf48Q96LS8 159 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 K7EIL1 84 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV6-57P01721 117 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE2BQ13066 116 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 ESRGQ1W209 222 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE2EQ4V326 116 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 Q8NDZ9 215 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N814 137 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 IMUPQ9GZP8 106 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 MRAPQ8TCY5 172 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00643Q86TS7 51 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 H3BQ85 93 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 NCR3O14931 201 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 C15orf56Q8N910 161 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00575Q6W349 94 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 B9D2Q9BPU9 175 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 TTC32Q5I0X7 151 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 C6orf99Q4VX62 202 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-212ENST00000477970 VPREB1P12018 145 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 SLPIP03973 132 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 NOTCH1P46531 2555 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 hADV29S1A0JD25 119 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZRU5 148 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 CCKP06307 115 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 M0R378 163 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 DIRC1Q969H9 104 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 UPK3BQ9BT76 320 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 GHRHP01286 108 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 Q6JHZ5 121 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 SYCNQ0VAF6 134 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRF-212ENST00000477970 RMI2Q96E14 147 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 COX7BP24311 80 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZRP5 223 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00846Q9NV44 126 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 PDE6GP18545 87 aa8□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZQT0 140 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZQY7 126 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRF-212ENST00000477970 B5MCH6 92 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 USP17L23D6RBM5 183 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 COL7A1Q02388 2944 aa7.95□□□□□ -1.14
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