RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476998.5

ATXN10-208, Transcript of ataxin 10, human

TSL 3

Gene ATXN10, Length 482 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN10-208	ENST00000476998	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998		M0R378	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998		A0A096LNJ9	63 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	ATP5L	O75964	103 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	COLCA2	A8K830	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998		H3BRM9	83 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	NDUFA6	P56556	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN10-208	ENST00000476998	LINC01549	A6NIU2	74 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	CTAG1A	P78358	180 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	COX17	Q14061	63 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	DAND5	Q8N907	189 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998		A0A0U1RRA0	63 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	LINC00614	P0C842	121 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	TRGC2	P03986	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	LINC00158	P58513	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	HBD	P02042	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	COX19	Q49B96	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998		Q8NBF4	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN10-208	ENST00000476998	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	SPRR1A	P35321	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	NCR3	O14931	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	PRY	O14603	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	SPINK1	P00995	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998		B5MCH6	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998		Q8N377	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN10-208	ENST00000476998	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN10-208	ENST00000476998	MOBP	Q13875	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN10-208	ENST00000476998	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN10-208	ENST00000476998		Q9BRP9	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN10-208	ENST00000476998	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN10-208	ENST00000476998	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN10-208	ENST00000476998	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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