RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BDP58876 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BCP62807 126 aa8□□□□□ -1.13
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C9orf3-212ENST00000468164 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BHQ93079 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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C9orf3-212ENST00000468164 HERVK_113P61574 105 aa7.94□□□□□ -1.14
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C9orf3-212ENST00000468164 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.83□□□□□ -1.16
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C9orf3-212ENST00000468164 AKR1D1P51857 326 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 PRYO14603 147 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 DAND5Q8N907 189 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR4Q96PI1 79 aa7.78□□□□□ -1.16
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C9orf3-212ENST00000468164 S100A12P80511 92 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
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C9orf3-212ENST00000468164 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.75□□□□□ -1.17
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C9orf3-212ENST00000468164 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ATOH7Q8N100 152 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR1AP35321 89 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 NPC2P61916 151 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.72□□□□□ -1.17
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