RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 C2orf83Q53S99 150 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 MND1Q9BWT6 205 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 OTORQ9NRC9 128 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 IRGMA1A4Y4 181 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 H3BRN7 92 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R378 163 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 GNRH2O43555 120 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 CST7O76096 145 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 PKIAP61925 76 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 LYZL2Q7Z4W2 148 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR15Q8IV56 129 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 TCEAL7Q9BRU2 100 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 GGACTQ9BVM4 153 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 NPVFQ9HCQ7 196 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 OSTCQ9NRP0 149 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 ERG28Q9UKR5 140 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-203ENST00000459697 C20orf202A1L168 122 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 RBAKDNA6NC62 111 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 FABP2P12104 132 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SDC2P34741 201 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MT4P47944 62 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TMBIM6P55061 237 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 NCS1P62166 190 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC01554Q52M75 96 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 Q5W150 140 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 LHFPL1Q86WI0 220 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 OR5AC2Q9NZP5 309 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 CFDP00746 253 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MT-ND4LP03901 98 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TRGV9Q99603 122 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SAR1AQ9NR31 198 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-203ENST00000459697 A8MUU9 505 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-203ENST00000459697 RPS25P62851 125 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TERB2Q8NHR7 220 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 CEBPZOSA8MTT3 80 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R3E3 92 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 HBBP68871 147 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 BRK1Q8WUW1 75 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 H3BQ85 93 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 H3BT86 120 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 NUPR1O60356 82 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2D2P62837 147 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IMMP2LQ96T52 175 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 C7orf66A4D0T2 115 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 F6UZH7 168 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 HYPMO75409 117 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 SPINK1P00995 79 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLC6P0CF74 106 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 NMSQ5H8A3 153 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-203ENST00000459697 Q5XG85 94 aa2.22□□□□□ -2.05
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