RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 H3BNG1 76 aa10.76□□□□□ -0.69
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SHQ1-202ENST00000444040 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.73□□□□□ -0.69
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SHQ1-202ENST00000444040 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.64□□□□□ -0.71
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SHQ1-202ENST00000444040 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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SHQ1-202ENST00000444040 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.59□□□□□ -0.71
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.58□□□□□ -0.72
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SHQ1-202ENST00000444040 CRYGAP11844 174 aa10.44□□□□□ -0.74
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SHQ1-202ENST00000444040 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.44□□□□□ -0.74
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SHQ1-202ENST00000444040 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.43□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 Q6ZVQ6 151 aa10.43□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.43□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 CASC10Q5T4H9 136 aa10.42□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 C7orf33Q8WU49 177 aa10.41□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.41□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SHQ1-202ENST00000444040 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.4□□□□□ -0.74
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