RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 H0Y8G0 127 aa9.74□□□□□ -0.85
RBM39-215ENST00000442447 BCE1O60756 84 aa9.74□□□□□ -0.85
RBM39-215ENST00000442447 COX17Q14061 63 aa9.74□□□□□ -0.85
RBM39-215ENST00000442447 LEPROTL1O95214 131 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-215ENST00000442447 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-215ENST00000442447 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 VPREB1P12018 145 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 IGKV2D-28P01615 120 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 LINC00158P58513 81 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 Q8NDZ9 215 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 A0A0U1RRA0 63 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 FABP4P15090 132 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 UBE2AP49459 152 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 SMIM13P0DJ93 91 aa9.66□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-215ENST00000442447 LRP2P98164 4655 aa9.65□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 TMEM238C9JI98 176 aa9.64□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 PLNP26678 52 aa9.64□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.64□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 HERV-K104P63124 156 aa9.64□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.64□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 DPM2O94777 84 aa9.63□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 TMEM126AQ9H061 195 aa9.63□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.62□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 LEPROTO15243 131 aa9.62□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 PRLHP81277 87 aa9.62□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.62□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 M0R378 163 aa9.61□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.61□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.61□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 A0A087X002 238 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 IGKCP01834 107 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 HERVK_113P61574 105 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.6□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 LINC00587B1AMM8 73 aa9.59□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 J3QQQ9 107 aa9.59□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.59□□□□□ -0.87
RBM39-215ENST00000442447 NCR3O14931 201 aa9.58□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 CRYGAP11844 174 aa9.58□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 DAND5Q8N907 189 aa9.56□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.55□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.54□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 NMUP48645 174 aa9.54□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.54□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.53□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 PRYO14603 147 aa9.53□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 S100A6P06703 90 aa9.53□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.53□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.53□□□□□ -0.88
RBM39-215ENST00000442447 C3orf79P0CE67 100 aa9.52□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.52□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 LPAP08519 4548 aa9.51□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.51□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 E9PLD3 99 aa9.51□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 TSPAN13O95857 204 aa9.51□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 KRTDAPP60985 99 aa9.51□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.5□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.5□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.5□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.5□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 S100A2P29034 98 aa9.49□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 SPRR1AP35321 89 aa9.49□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 LINC01545Q5VT33 79 aa9.49□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.49□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 A0A0J9YXY3 114 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 C5orf52A6NGY3 159 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 PRR4Q16378 134 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 PET117Q6UWS5 81 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.47□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RBM39-215ENST00000442447 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 DDTP30046 118 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 NPC2P61916 151 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 RNF213Q63HN8 5207 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 S100A12P80511 92 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 SPRR4Q96PI1 79 aa9.45□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.44□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.44□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 NDUFC2O95298 119 aa9.43□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.43□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.42□□□□□ -0.9
RBM39-215ENST00000442447 ATOH7Q8N100 152 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms