RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428818.5

TTC28-AS1-208, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTC28-AS1, Length 706 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.88□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CKS1BP61024 79 aa5.88□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DPH3Q96FX2 82 aa5.88□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM223A0PJW6 202 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 H3BRM9 83 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 S100A1P23297 94 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.87□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 F8WDY8 70 aa5.86□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CXCL5P42830 114 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 Q8NDZ9 215 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 M0QXV9 152 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PFN2P35080 140 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 A0A0U1RRA0 63 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DPM2O94777 84 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C7orf33Q8WU49 177 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ERG28Q9UKR5 140 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGKCP01834 107 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C3orf79P0CE67 100 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLNP26678 52 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KRTDAPP60985 99 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LINC01545Q5VT33 79 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GAGE10A6NGK3 116 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMIM13P0DJ93 91 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LEPROTO15243 131 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ATOH7Q8N100 152 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DAND5Q8N907 189 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C22orf24Q9Y442 160 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VPREB1P12018 145 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 UBE2BP63146 152 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C1orf137Q5JT78 98 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 J3QQQ9 107 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LINC00158P58513 81 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PET117Q6UWS5 81 aa5.76□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 E9PLD3 99 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HERVK_113P61574 105 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LINC00167Q96N53 147 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.75□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.74□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MT1HL1P0DM35 61 aa5.74□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NCR3O14931 201 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGKV2D-28P01615 120 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGLV7-43P04211 117 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NPC2P61916 151 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.73□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 A0A0J9YXY3 114 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM238C9JI98 176 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HERV-K104P63124 156 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 COX17Q14061 63 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.72□□□□□ -1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SFTA2Q6UW10 78 aa5.71□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LITAFQ99732 161 aa5.71□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C20orf202A1L168 122 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C5orf52A6NGY3 159 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZNF815PA8K554 130 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 S100A6P06703 90 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 S100A2P29034 98 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NMUP48645 174 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PCP2Q8IVA1 136 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.7□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRLHP81277 87 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.69□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 M0R378 163 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.68□□□□□ -1.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 H0Y9J4 135 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms