RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.16□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LITAFQ99732 161 aa10.16□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLK9Q2XQG4 91 aa10.15□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C16orf90A8MZG2 172 aa10.15□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPM2AB3EWF7 344 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CACNA1AO00555 2505 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.14□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTPRBP23467 1997 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.13□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00313P59037 77 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV6-57P01721 117 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q8NAQ8 132 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RTL8CO15255 209 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q6ZRP5 223 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERC2-IT1O76042 136 aa10.07□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.07□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.07□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPREB1P12018 145 aa10.06□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM229AH3BQW9 127 aa10.06□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.06□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MWP4 228 aa10.05□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHTF8P0CG12 524 aa10.05□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C8orf87E5RJ46 101 aa10.04□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.04□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.03□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.03□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 K7EQZ3 153 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGF2RP11717 2491 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCOR2Q9Y618 2525 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM168BA1KXE4 195 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q96NJ1 140 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COA5Q86WW8 74 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIEZO1Q92508 2521 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGFL1Q6UW32 110 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MUN3 132 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCSK5Q92824 1860 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLKP1Q107X0 134 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC01600Q96MT4 127 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR34Q9NV39 138 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR15Q8IV56 129 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C15orf56Q8N910 161 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UQCR11O14957 56 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q8N377 158 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1B0GVX0 72 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DSCR10P59022 87 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-11P60412 298 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 K7EIL1 84 aa9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF861PO60384 105 aa9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H7BZZ5 65 aa9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A096LNT2 108 aa9.76□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 J3QL48 77 aa9.74□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.74□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRK2Q5S007 2527 aa9.74□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.71□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A087WTM6 91 aa9.7□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APLNQ9ULZ1 77 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRIPTQ9P021 101 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0G2JQZ4 141 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PNN7 141 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms