RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WTM6 91 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 LECT2O14960 151 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN13O95857 204 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 PSMB2P49721 201 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 VAMP3Q15836 100 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZRP5 223 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N814 137 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE10A6NGK3 116 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf90A8MZG2 172 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 H0YGX0 51 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 K7ERJ3 54 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 M0R378 163 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2D-28P01615 120 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 Q1RN00 199 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE2EQ4V326 116 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GV90 55 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 SNCGO76070 127 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-211ENST00000425989 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2V1Q13404 147 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC2Q14508 124 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 LCE6AA0A183 80 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV6-57P01721 117 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 VPREB1P12018 145 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE2BQ13066 116 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GX51 115 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 H7C2G1 150 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 K7EP34 96 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 ATXN8Q156A1 80 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 RYR3Q15413 4870 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 TRIAP1O43715 76 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 F8W1H4 67 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 GHRHP01286 108 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 LYSTQ99698 3801 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 H3BQ85 93 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 NCR3O14931 201 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 RTL8CO15255 209 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 C22orf24Q9Y442 160 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 A0A096LNI7 61 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 TRACP01848 142 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 Q8NDZ9 215 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 DPH3Q96FX2 82 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 EPM2AB3EWF7 344 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 M0QXV9 152 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 LST1O00453 97 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 TCL1BO95988 128 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 TNP2Q05952 138 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 DIRC1Q969H9 104 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 H3BMG7 143 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 PRYO14603 147 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A20O43772 301 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf99Q4VX62 202 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf33Q8WU49 177 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01600Q96MT4 127 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00167Q96N53 147 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 KMT2AQ03164 3969 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PNN7 141 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 DNAL4O96015 105 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 COX7BP24311 80 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01620Q4KN68 170 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-211ENST00000425989 H3BT86 120 aa6.09□□□□□ -1.43
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