RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6JHZ5 121 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00167Q96N53 147 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WVE0 104 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf223Q8N319 242 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CELA1Q9UNI1 258 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HTN3P15516 51 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf99Q4VX62 202 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.7□□□□□ -0.38
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SH3BP1-202ENST00000417536 CCKP06307 115 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf25Q5T742 122 aa12.7□□□□□ -0.38
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GX51 115 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 COX7CP15954 63 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ATOX1O00244 68 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf48Q96LS8 159 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG11BQ08648 103 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP1-202ENST00000417536 KLK12Q9UKR0 248 aa12.64□□□□□ -0.39
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SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00575Q6W349 94 aa12.62□□□□□ -0.39
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SH3BP1-202ENST00000417536 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 hADV29S1A0JD25 119 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L23D6RBM5 183 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MIFP14174 115 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYGAP11844 174 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YWU9 116 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ENHOQ6UWT2 76 aa12.57□□□□□ -0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 PRR34Q9NV39 138 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SERP2Q8N6R1 65 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH3Q8TD57 4116 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV6-57P01721 117 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 UBL5Q9BZL1 73 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC7Q8TAX7 377 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 COL7A1Q02388 2944 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZQT0 140 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.51□□□□□ -0.41
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SH3BP1-202ENST00000417536 MRAPQ8TCY5 172 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 UPK3BQ9BT76 320 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 MDFIQ99750 246 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 GHRHP01286 108 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 DIRC1Q969H9 104 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-202ENST00000417536 DSCR8Q96T75 97 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 HAMPP81172 84 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 COX7BP24311 80 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZTC4 211 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 J3KT08 172 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZVQ6 151 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZRU5 148 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 VPREB1P12018 145 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TENM2Q9NT68 2774 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 LYSTQ99698 3801 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM258P61165 79 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 DNHD1Q96M86 4753 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf56Q8N910 161 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BQ85 93 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE6GP18545 87 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EIL1 84 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R378 163 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf197Q8N268 126 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 DPH3Q96FX2 82 aa12.33□□□□□ -0.44
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