RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 PSCAO43653 123 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 LY6G6CO95867 125 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2V1Q13404 147 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 CARD19Q96LW7 228 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 K7EP34 96 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 COX6CP09669 75 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZRU5 148 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2D-28P01615 120 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 PSMB2P49721 201 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 Q1RN00 199 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM126AQ9H061 195 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.4□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZR54 194 aa6.4□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.4□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 KMT2AQ03164 3969 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 HERC1Q15751 4861 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 H0YGX0 51 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 H7C2G1 150 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 TRIAP1O43715 76 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 SLPIP03973 132 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZRP5 223 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 F8W1H4 67 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 M0R378 163 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 ATXN8Q156A1 80 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV6-57P01721 117 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 VPREB1P12018 145 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GX51 115 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 M0QXV9 152 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 TCL1BO95988 128 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1A-202ENST00000409024 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 C16orf90A8MZG2 172 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 H3BMG7 143 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 LST1O00453 97 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 LECT2O14960 151 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC2Q14508 124 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE2EQ4V326 116 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N814 137 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01600Q96MT4 127 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WTM6 91 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 M0R2N4 97 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 SNCGO76070 127 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 TRACP01848 142 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 PKHD1P08F94 4074 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 NCR3O14931 201 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 Q8NDZ9 215 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE2BQ13066 116 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01620Q4KN68 170 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 PRO0461Q9UI25 63 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 H3BT86 120 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 H3BQ85 93 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 DIRC1Q969H9 104 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A20O43772 301 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf99Q4VX62 202 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 CLEC2BQ92478 149 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 A0A096LNI7 61 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 C9JAW5 83 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 PRYO14603 147 aa6.26□□□□□ -1.41
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