RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-2P60368 255 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2V1Q13404 147 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 PCP2Q8IVA1 136 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf86A6NJI1 115 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM6Q96B49 74 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 PRLHP81277 87 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 C22orf24Q9Y442 160 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 A0A096LNJ9 63 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 Q6Q795 121 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 M0R378 163 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 COX7BP24311 80 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-1P60331 282 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA45Q537H7 98 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 Q8IZM0 81 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 MTURNQ8N3F0 131 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS5O43920 106 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 SIGMAR1Q99720 223 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC2Q14508 124 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01546A6NGU7 62 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZR54 194 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 IGIPA6NJ69 53 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01545Q5VT33 79 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB1A1P11684 91 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 FAM236CP0DP71 79 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 F8WDY8 70 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 TCL1BO95988 128 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf25Q5T742 122 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00167Q96N53 147 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 hADV29S1A0JD25 119 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB1O75438 58 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf99Q4VX62 202 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N1X5 172 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y9J4 135 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-201ENST00000348564 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TRACP01848 142 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 IGLC3P0DOY3 106 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 MOBPQ13875 183 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 AMELXQ99217 191 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXCQ9NY87 97 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 FAM168BA1KXE4 195 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 J3QR89 54 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 IFITM1P13164 125 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 DSCR8Q96T75 97 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 PRR34Q9NV39 138 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 FAM30AQ9NZY2 134 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 COX17Q14061 63 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN8Q156A1 80 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 H3BMG7 143 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SLPIP03973 132 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV7-43P04211 117 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 COX8AP10176 69 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 E9PLD3 99 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF861PO60384 105 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf56Q8N910 161 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 LIMD2Q9BT23 127 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RQV1 116 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 BCE1O60756 84 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-201ENST00000348564 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.86□□□□□ -1.95
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