RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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PTPRO-201ENST00000281171 NOTCH2Q04721 2471 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRO-201ENST00000281171 PIEZO1Q92508 2521 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRO-201ENST00000281171 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PPR1 153 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-9P60411 292 aa9.91□□□□□ -0.82
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PTPRO-201ENST00000281171 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZRU5 148 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRO-201ENST00000281171 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRO-201ENST00000281171 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRO-201ENST00000281171 Q5VV11 94 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRO-201ENST00000281171 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRO-201ENST00000281171 FAM229AH3BQW9 127 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRO-201ENST00000281171 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRO-201ENST00000281171 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRO-201ENST00000281171 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRO-201ENST00000281171 Q8NAQ8 132 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRO-201ENST00000281171 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRO-201ENST00000281171 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRO-201ENST00000281171 Q8N377 158 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRO-201ENST00000281171 IGFL1Q6UW32 110 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRO-201ENST00000281171 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRO-201ENST00000281171 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PNM2 257 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRO-201ENST00000281171 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRO-201ENST00000281171 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GVX0 72 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRO-201ENST00000281171 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRO-201ENST00000281171 LUZP6Q538Z0 58 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRO-201ENST00000281171 MUC4Q99102 2169 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRO-201ENST00000281171 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.4□□□□□ -0.9
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