RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam19a2Q7TPG7 131 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RnasekQ8K3C0 98 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndfip1Q8R0W6 221 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1402Q8VET1 320 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr975Q8VG91 310 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Leprotl1Q9CQ74 131 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Necap1Q9CR95 275 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abca12E9Q876 2595 aa16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp979A2A799 407 aa16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc17a2Q5SZA1 478 aa16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem177Q8BPE4 311 aa16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr877Q8VF62 311 aa16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nbeal1E9PYP2 2688 aa16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IgipA0A1B0GR74 53 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl2P10148 148 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sox15P43267 231 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cox7a2P48771 83 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930474N05RikQ8BVR5 218 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A730015C16RikQ8C992 119 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C1qtnf5Q8K479 243 aa16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15127B1AVZ5 449 aa16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20458E9PXJ7 78 aa16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpp30O88796 268 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc25a5P51881 298 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AsipQ03288 131 aa16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Malsu1Q9CWV0 228 aa16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Susd2Q9DBX3 820 aa16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15128A2ADW8 449 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15093A2BI72 449 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Luzp4B1AV09 449 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15107B1B0X0 449 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd209gD3Z5D4 194 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15097E9QA14 449 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IappP12968 93 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CtsgP28293 261 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr150Q60895 312 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15085Q62012 449 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Epg5Q80TA9 2572 aa16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01806 116 aa16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PpbpQ9EQI5 113 aa16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm14214V9GX35 225 aa16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr491Q8VG06 310 aa16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Them7Q9DCP4 223 aa16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ash1lQ99MY8 2958 aa16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubald1Q6P3B2 176 aa16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab1bQ9D1G1 201 aa16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10073E9Q3T0 114 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3072F6SKY8 209 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TfpiO54819 306 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc9cQ810A3 171 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav6-6A0A075B603 114 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhox7bA6PW38 321 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm27021M0QWE2 156 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arl6ip6Q8BH07 226 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mogat1Q91ZV4 335 aa16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl13a-ps1A0A140T8K2 203 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r216Q8R257 298 aa16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl20Q9CQL4 149 aa16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Osr1Q9WVG7 266 aa16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav14-3A0A075B607 120 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4565A0A140LJ87 301 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6176J3QK59 301 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Brs3O54798 399 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc25a17O70579 307 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P0C1Z5 52 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RhogP84096 191 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4567Q3UTA8 301 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oosp2Q4FZG8 168 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gng5Q80SZ7 68 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slamf7Q8BHK6 333 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ociad1Q9CRD0 247 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psmb2Q9R1P3 201 aa16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nat8f4G5E8L3 226 aa16.46■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Casp6O08738 276 aa16.46■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01792 123 aa16.46■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp6v0cP63082 155 aa16.46■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OtosQ8R448 89 aa16.46■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vps25Q9CQ80 176 aa16.46■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01725 110 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P18529 117 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlx6P70397 175 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ercc8Q8CFD5 397 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Golt1bQ9CR60 138 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam213bQ9DB60 201 aa16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HrkP62816 92 aa16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav7n-5A0A075B604 112 aa16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6096D3YTY6 151 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.6 ms