Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PpbpQ9EQI5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PpbpQ9EQI5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PpbpQ9EQI5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PpbpQ9EQI5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PpbpQ9EQI5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PpbpQ9EQI5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpbpQ9EQI5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PpbpQ9EQI5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PpbpQ9EQI5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpbpQ9EQI5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpbpQ9EQI5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpbpQ9EQI5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PpbpQ9EQI5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PpbpQ9EQI5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PpbpQ9EQI5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PpbpQ9EQI5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpbpQ9EQI5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpbpQ9EQI5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpbpQ9EQI5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PpbpQ9EQI5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PpbpQ9EQI5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpbpQ9EQI5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PpbpQ9EQI5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PpbpQ9EQI5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpbpQ9EQI5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpbpQ9EQI5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PpbpQ9EQI5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PpbpQ9EQI5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PpbpQ9EQI5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PpbpQ9EQI5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PpbpQ9EQI5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpbpQ9EQI5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PpbpQ9EQI5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpbpQ9EQI5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpbpQ9EQI5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpbpQ9EQI5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpbpQ9EQI5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpbpQ9EQI5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpbpQ9EQI5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PpbpQ9EQI5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PpbpQ9EQI5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpbpQ9EQI5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpbpQ9EQI5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpbpQ9EQI5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpbpQ9EQI5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpbpQ9EQI5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpbpQ9EQI5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PpbpQ9EQI5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpbpQ9EQI5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpbpQ9EQI5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpbpQ9EQI5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpbpQ9EQI5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpbpQ9EQI5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PpbpQ9EQI5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PpbpQ9EQI5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpbpQ9EQI5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PpbpQ9EQI5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpbpQ9EQI5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpbpQ9EQI5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpbpQ9EQI5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpbpQ9EQI5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpbpQ9EQI5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpbpQ9EQI5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpbpQ9EQI5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpbpQ9EQI5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpbpQ9EQI5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PpbpQ9EQI5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpbpQ9EQI5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpbpQ9EQI5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpbpQ9EQI5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpbpQ9EQI5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpbpQ9EQI5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpbpQ9EQI5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PpbpQ9EQI5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpbpQ9EQI5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PpbpQ9EQI5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpbpQ9EQI5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpbpQ9EQI5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpbpQ9EQI5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PpbpQ9EQI5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PpbpQ9EQI5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpbpQ9EQI5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpbpQ9EQI5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpbpQ9EQI5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpbpQ9EQI5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PpbpQ9EQI5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpbpQ9EQI5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpbpQ9EQI5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpbpQ9EQI5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpbpQ9EQI5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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