Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pgpep1lQ9CWB5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pgpep1lQ9CWB5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Pgpep1lQ9CWB5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pgpep1lQ9CWB5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pgpep1lQ9CWB5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pgpep1lQ9CWB5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pgpep1lQ9CWB5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pgpep1lQ9CWB5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pgpep1lQ9CWB5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pgpep1lQ9CWB5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pgpep1lQ9CWB5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pgpep1lQ9CWB5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pgpep1lQ9CWB5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pgpep1lQ9CWB5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pgpep1lQ9CWB5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pgpep1lQ9CWB5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pgpep1lQ9CWB5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pgpep1lQ9CWB5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pgpep1lQ9CWB5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pgpep1lQ9CWB5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pgpep1lQ9CWB5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pgpep1lQ9CWB5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pgpep1lQ9CWB5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pgpep1lQ9CWB5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pgpep1lQ9CWB5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pgpep1lQ9CWB5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pgpep1lQ9CWB5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pgpep1lQ9CWB5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pgpep1lQ9CWB5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pgpep1lQ9CWB5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pgpep1lQ9CWB5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pgpep1lQ9CWB5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pgpep1lQ9CWB5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pgpep1lQ9CWB5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pgpep1lQ9CWB5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pgpep1lQ9CWB5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pgpep1lQ9CWB5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pgpep1lQ9CWB5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pgpep1lQ9CWB5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pgpep1lQ9CWB5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgpep1lQ9CWB5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pgpep1lQ9CWB5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgpep1lQ9CWB5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pgpep1lQ9CWB5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pgpep1lQ9CWB5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pgpep1lQ9CWB5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pgpep1lQ9CWB5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pgpep1lQ9CWB5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pgpep1lQ9CWB5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pgpep1lQ9CWB5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgpep1lQ9CWB5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pgpep1lQ9CWB5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pgpep1lQ9CWB5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgpep1lQ9CWB5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgpep1lQ9CWB5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pgpep1lQ9CWB5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgpep1lQ9CWB5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pgpep1lQ9CWB5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgpep1lQ9CWB5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgpep1lQ9CWB5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pgpep1lQ9CWB5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pgpep1lQ9CWB5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pgpep1lQ9CWB5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pgpep1lQ9CWB5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pgpep1lQ9CWB5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pgpep1lQ9CWB5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pgpep1lQ9CWB5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pgpep1lQ9CWB5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pgpep1lQ9CWB5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pgpep1lQ9CWB5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pgpep1lQ9CWB5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pgpep1lQ9CWB5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pgpep1lQ9CWB5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pgpep1lQ9CWB5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pgpep1lQ9CWB5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgpep1lQ9CWB5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgpep1lQ9CWB5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgpep1lQ9CWB5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgpep1lQ9CWB5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgpep1lQ9CWB5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgpep1lQ9CWB5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgpep1lQ9CWB5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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