Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv5-16A0A0B4J1P4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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