Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Brs3O54798 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brs3O54798 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brs3O54798 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Brs3O54798 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brs3O54798 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Brs3O54798 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brs3O54798 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Brs3O54798 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brs3O54798 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brs3O54798 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brs3O54798 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brs3O54798 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Brs3O54798 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brs3O54798 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brs3O54798 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brs3O54798 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Brs3O54798 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brs3O54798 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brs3O54798 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brs3O54798 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brs3O54798 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Brs3O54798 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brs3O54798 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brs3O54798 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brs3O54798 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Brs3O54798 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brs3O54798 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brs3O54798 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brs3O54798 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brs3O54798 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brs3O54798 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brs3O54798 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brs3O54798 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brs3O54798 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brs3O54798 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brs3O54798 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brs3O54798 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brs3O54798 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brs3O54798 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brs3O54798 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brs3O54798 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brs3O54798 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brs3O54798 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brs3O54798 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brs3O54798 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brs3O54798 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brs3O54798 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brs3O54798 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Brs3O54798 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brs3O54798 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brs3O54798 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brs3O54798 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brs3O54798 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brs3O54798 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brs3O54798 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brs3O54798 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brs3O54798 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brs3O54798 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brs3O54798 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brs3O54798 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brs3O54798 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brs3O54798 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brs3O54798 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brs3O54798 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brs3O54798 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brs3O54798 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brs3O54798 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brs3O54798 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brs3O54798 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brs3O54798 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brs3O54798 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brs3O54798 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brs3O54798 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brs3O54798 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brs3O54798 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brs3O54798 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brs3O54798 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brs3O54798 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brs3O54798 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Brs3O54798 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brs3O54798 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brs3O54798 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brs3O54798 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brs3O54798 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brs3O54798 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brs3O54798 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brs3O54798 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brs3O54798 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brs3O54798 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brs3O54798 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brs3O54798 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brs3O54798 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brs3O54798 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms