RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa15.91■□□□□ 0.14
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CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00167Q96N53 147 aa15.91■□□□□ 0.14
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CAPNS1-217ENST00000629983 F8VRH5 84 aa15.9■□□□□ 0.14
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CAPNS1-217ENST00000629983 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.86■□□□□ 0.13
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CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP14Q86UN6 197 aa15.82■□□□□ 0.12
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CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N8P6 123 aa15.79■□□□□ 0.12
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2D-28P01615 120 aa15.76■□□□□ 0.11
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CAPNS1-217ENST00000629983 PEA15Q15121 130 aa15.73■□□□□ 0.11
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa15.72■□□□□ 0.11
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CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.7■□□□□ 0.1
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CAPNS1-217ENST00000629983 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.58■□□□□ 0.08
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.55■□□□□ 0.08
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CAPNS1-217ENST00000629983 CST9LQ9H4G1 147 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.49■□□□□ 0.07
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CAPNS1-217ENST00000629983 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR4Q96PI1 79 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DAND5Q8N907 189 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ERG28Q9UKR5 140 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8NBF4 154 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PMVKQ15126 192 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01549A6NIU2 74 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8NDZ9 215 aa15.4■□□□□ 0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.38■□□□□ 0.05
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