RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 KLLNB2CW77 178 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZS46 218 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZPA2 131 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 IGIPA6NJ69 53 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf48Q96LS8 159 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB4AO15263 64 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GUV1 79 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 Q9BRP9 147 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRT-209ENST00000612229 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 CRIPTQ9P021 101 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 Q6YL49 198 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00310P59036 64 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PRLHP81277 87 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 MOBPQ13875 183 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 ERC2-IT1O76042 136 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LUZP6Q538Z0 58 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 MSMPQ1L6U9 139 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 IGF2RP11717 2491 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 SPINK1P00995 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 UQCR11O14957 56 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WYN8 130 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 EDN2P20800 178 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LMO4P61968 165 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PIEZO1Q92508 2521 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PROK1P58294 105 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01546A6NGU7 62 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LY6G6DO95868 133 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 PRR9Q5T870 116 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 AMELXQ99217 191 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 CDIP1Q9H305 208 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 CD164Q04900 197 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-209ENST00000612229 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF580Q9UK33 172 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WSZ3 146 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WVE0 104 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 GAS8-AS1O95177 125 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV1-40P01703 118 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 JMJD1CQ15652 2540 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV2-30P06310 120 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00313P59037 77 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf72Q8NBR9 251 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 PCOTHQ58A44 107 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf223Q8N319 242 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 COX6A2Q02221 97 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 FAM229AH3BQW9 127 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00846Q9NV44 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LY6G6CO95867 125 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0087Q14695 138 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 BRI3O95415 125 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 Q8NA96 180 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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