RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 C2orf48Q96LS8 159 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 CARD19Q96LW7 228 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 E9PLD3 99 aa6.62□□□□□ -1.35
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ITGB5-211ENST00000608107 HERVK_113P61574 105 aa6.62□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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ITGB5-211ENST00000608107 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.62□□□□□ -1.35
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ITGB5-211ENST00000608107 PCP2Q8IVA1 136 aa6.57□□□□□ -1.36
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ITGB5-211ENST00000608107 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ITGB5-211ENST00000608107 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.55□□□□□ -1.36
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ITGB5-211ENST00000608107 SFTA2Q6UW10 78 aa6.53□□□□□ -1.36
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ITGB5-211ENST00000608107 Q8NDZ9 215 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM6P0DI80 62 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 NPC2P61916 151 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00587B1AMM8 73 aa6.47□□□□□ -1.37
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