RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZVQ6 151 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 PRO0628Q9UI54 55 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 PDE6GP18545 87 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 M0R2N4 97 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 SORL1Q92673 2214 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 NDUFC1O43677 76 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 IGLV6-57P01721 117 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 C6orf99Q4VX62 202 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 ERC2-IT1O76042 136 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 COL12A1Q99715 3063 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.71□□□□□ -1.33
HCG18-242ENST00000602319 RMI2Q96E14 147 aa6.71□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YWU9 116 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 CCL24O00175 119 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 F8WEM9 126 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 ZNF843Q8N446 348 aa6.7□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 IGLV1-51P01701 117 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 ESM1Q9NQ30 184 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 CELA1Q9UNI1 258 aa6.69□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 SPTA1P02549 2419 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 Q8N3U1 123 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 GYPEP15421 78 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 SNURFQ9Y675 71 aa6.67□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.67□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 MIFP14174 115 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 HAMPP81172 84 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZQY7 126 aa6.66□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 NREPQ16612 68 aa6.65□□□□□ -1.34
HCG18-242ENST00000602319 A0A0U1RQV1 116 aa6.65□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.65□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 PRO0255Q9UI72 69 aa6.65□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.65□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 C10orf25Q5T742 122 aa6.65□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 TTC28Q96AY4 2481 aa6.65□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 AKAP6Q13023 2319 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 ITPR1Q14643 2758 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 OCR1Q9BZK8 76 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 IGKV4-1P06312 121 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 REG3AQ06141 175 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 LINC01006Q8NI28 216 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 X6R8D5 127 aa6.64□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 LCE6AA0A183 80 aa6.63□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 DIRC1Q969H9 104 aa6.63□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 COX7BP24311 80 aa6.63□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 ATRXP46100 2492 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 BPY2O14599 106 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 PRR34Q9NV39 138 aa6.62□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 FBN2P35556 2912 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 SPAG11BQ08648 103 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZTC4 211 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 DEFB130BP0DP73 79 aa6.6□□□□□ -1.35
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