RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301		Q6ZN92	141 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301		Q8N8P6	123 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	UBE2D1	P51668	147 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	SEC11A	P67812	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	VCX2	Q9H322	139 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	AMELX	Q99217	191 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	PRSS2	P07478	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	HERVK_113	P63121	156 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	TNXB	P22105	4242 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	CKS1B	P61024	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301		Q8IZM0	81 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301		M0QXV9	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	S100P	P25815	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	CXCL5	P42830	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301		F8VRH5	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301		H0Y9J4	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	UBE2B	P63146	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	COX19	Q49B96	90 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301		H0Y8G0	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	NUPR1	O60356	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	RHEB	Q15382	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	LRP2	P98164	4655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF861P	O60384	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	PMVK	Q15126	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPC1-208	ENST00000590301	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301		H3BRM9	83 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301	ATP5L	O75964	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPC1-208	ENST00000590301	APOC3	P02656	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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