RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 C12orf57Q99622 126 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 SFTA2Q6UW10 78 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 NDUFA1O15239 70 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 TNP2Q05952 138 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 Q8N814 137 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 C2orf48Q96LS8 159 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN4-210ENST00000588618 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 F8WDY8 70 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 C2orf82Q6UX34 121 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 PCP2Q8IVA1 136 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.81□□□□□ -0.04
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ACTN4-210ENST00000588618 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF815PA8K554 130 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 SYCNQ0VAF6 134 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 PKD1P98161 4303 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 CARD19Q96LW7 228 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 HERV-K104P63124 156 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTN4-210ENST00000588618 SLPIP03973 132 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTN4-210ENST00000588618 Q6ZRU5 148 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTN4-210ENST00000588618 C14orf144Q96I85 54 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTN4-210ENST00000588618 C10orf25Q5T742 122 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTN4-210ENST00000588618 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-210ENST00000588618 PRO1933Q9H354 126 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN4-210ENST00000588618 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTN4-210ENST00000588618 ERG28Q9UKR5 140 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN4-210ENST00000588618 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.69□□□□□ -0.06
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ACTN4-210ENST00000588618 RNF151Q2KHN1 245 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTN4-210ENST00000588618 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTN4-210ENST00000588618 DLEU1O43261 78 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTN4-210ENST00000588618 COX17Q14061 63 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-210ENST00000588618 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
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ACTN4-210ENST00000588618 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN4-210ENST00000588618 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN4-210ENST00000588618 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 KRTAP10-2P60368 255 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 LITAFQ99732 161 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 TIMM17BO60830 172 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN4-210ENST00000588618 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.58□□□□□ -0.07
ACTN4-210ENST00000588618 GAGE2BQ13066 116 aa14.58□□□□□ -0.08
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ACTN4-210ENST00000588618 DAND5Q8N907 189 aa14.58□□□□□ -0.08
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ACTN4-210ENST00000588618 GCSHP23434 173 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 A0A1B0GVY2 172 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 Q6ZVH6 145 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 HIST1H4GQ99525 98 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 C16orf90A8MZG2 172 aa14.53□□□□□ -0.08
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ACTN4-210ENST00000588618 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 SPANXCQ9NY87 97 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 PTTG1IPP53801 180 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 NPC2P61916 151 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTN4-210ENST00000588618 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-210ENST00000588618 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-210ENST00000588618 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.51□□□□□ -0.09
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