RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-215ENST00000586268 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.31□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 PRSS2P07478 247 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 HERV-K104P63124 156 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 A0A0J9YXY3 114 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 CXCL5P42830 114 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 HSD52Q0P140 79 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 KIAA0087Q14695 138 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 CASC10Q5T4H9 136 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 COX11Q9Y6N1 276 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 TIMM17BO60830 172 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 SPAG11BQ08648 103 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 TAL2Q16559 108 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 CFAP161Q6P656 301 aa9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
NEDD4L-215ENST00000586268 TGP01266 2768 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 TM2D2Q9BX73 214 aa9.27□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 TMEM238C9JI98 176 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.26□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 M0R143 59 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 CKS1BP61024 79 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 C15orf56Q8N910 161 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 LITAFQ99732 161 aa9.25□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 HIST1H4GQ99525 98 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 SPANXCQ9NY87 97 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 TENM2Q9NT68 2774 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 F8WDY8 70 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 Q6ZVH6 145 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.935e-8■■■■□ 20.2
NEDD4L-215ENST00000586268 C2orf82Q6UX34 121 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 CEND1Q8N111 149 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 C2orf48Q96LS8 159 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD4L-215ENST00000586268 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 EREGO14944 169 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 GCSHP23434 173 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 ERG28Q9UKR5 140 aa9.21□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 USP17L23D6RBM5 183 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 SMIM13P0DJ93 91 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 Q6ZR54 194 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 C6orf223Q8N319 242 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LY6G6CO95867 125 aa9.19□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 IFITM1P13164 125 aa9.19□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 BATFQ16520 125 aa9.19□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.19□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.19□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 PSCAO43653 123 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 PTTG1IPP53801 180 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 FXYD2P54710 66 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 COX17Q14061 63 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LYSTQ99698 3801 aa9.18□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.17□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 M0R2N4 97 aa9.17□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LINC00158P58513 81 aa9.17□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 C10orf25Q5T742 122 aa9.17□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LCE1DQ5T752 114 aa9.17□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 COPS9Q8WXC6 57 aa9.17□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 A0A0U1RRA0 63 aa9.16□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.16□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.16□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.16□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 A6NDN8 102 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 PFN2P35080 140 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 SYCNQ0VAF6 134 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 C14orf177Q52M58 125 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 Q6ZRU5 148 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 DAND5Q8N907 189 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.15□□□□□ -0.94
NEDD4L-215ENST00000586268 RNF151Q2KHN1 245 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.14□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 LECT2O14960 151 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 WFDC2Q14508 124 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 CARD19Q96LW7 228 aa9.13□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 A0A1B0GWB2 263 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 A4D1N5 150 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.12□□□□□ -0.95
NEDD4L-215ENST00000586268 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 192.5 ms