RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583658.1

LLGL2-222, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-222	ENST00000583658	RHEB	Q15382	184 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	CXCL5	P42830	114 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLV7-43	P04211	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	DIRC1	Q969H9	104 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658		M0QXV9	152 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658		F8VRH5	84 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	FA2H	Q7L5A8	372 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	UBE2B	P63146	152 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658		H0Y9J4	135 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	PMVK	Q15126	192 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	COX7B2	Q8TF08	81 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658	LRP2	P98164	4655 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LLGL2-222	ENST00000583658		H3BRM9	83 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	NUPR1	O60356	82 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	C22orf24	Q9Y442	160 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC00614	P0C842	121 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LLGL2-222	ENST00000583658	SNAPIN	O95295	136 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	HBD	P02042	147 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	SPINK8	P0C7L1	97 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	RAB5B	P61020	215 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	SVBP	Q8N300	66 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658		A0A096LNJ9	63 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF861P	O60384	105 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	ATP5L	O75964	103 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	APOC3	P02656	99 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	NDUFA6	P56556	154 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LLGL2-222	ENST00000583658	BCE1	O60756	84 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	SFTA2	Q6UW10	78 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC00167	Q96N53	147 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	COX17	Q14061	63 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	ERG28	Q9UKR5	140 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	C11orf86	A6NJI1	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LLGL2-222	ENST00000583658	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	PFN2	P35080	140 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	GAGE10	A6NGK3	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	RNF213	Q63HN8	5207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	VPREB1	P12018	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	UBE2A	P49459	152 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LLGL2-222	ENST00000583658	CRYGA	P11844	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM223	A0PJW6	202 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	IGKV2D-28	P01615	120 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	HSBP1	O75506	76 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	LPA	P08519	4548 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658		A0A087X002	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	SCO1	O75880	301 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC00158	P58513	81 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM126A	Q9H061	195 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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