RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 MED14OSP0DP75 135 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 SLC25A20O43772 301 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-1P60331 282 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 Q6ZR54 194 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.09□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 LAGE3Q14657 143 aa5.09□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.09□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.09□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 ODF3Q96PU9 254 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 ZNF815PA8K554 130 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 HSPG2P98160 4391 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 C9JAW5 83 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 CHTF8P0CG12 524 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 RHOHQ15669 191 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 RNF213Q63HN8 5207 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SFTA2Q6UW10 78 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 NRACQ8N912 160 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SPANXCQ9NY87 97 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 A0A087WTM6 91 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 CRPP02741 224 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 CFC1BP0CG36 223 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 CFC1P0CG37 223 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GX51 115 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 HERVK_113P61574 105 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 TOMM6Q96B49 74 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 ATXN8Q156A1 80 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 A8MTW9 85 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 XCL1P47992 114 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 A0A0B4J2C4 111 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GVY2 172 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 IMUPQ9GZP8 106 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 EPM2AB3EWF7 344 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 J3KT08 172 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 LINC00694P0DN24 101 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 H3BT86 120 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 TMEM101Q96IK0 257 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-212ENST00000548567 PKD1P98161 4303 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 UBE2L6O14933 153 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 Q5VSD8 79 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 RBAKDNA6NC62 111 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 UQCRQO14949 82 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 A0A0J9YXV3 536 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 RS1O15537 224 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C9orf85Q96MD7 179 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 J3QL48 77 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C2orf82Q6UX34 121 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 LINC00612Q8N6U2 182 aa5□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 A4D1N5 150 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C11orf86A6NJI1 115 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 PANO1I0J062 215 aa4.99□□□□□ -1.61
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