RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548343.1

RPL6-204, Transcript of ribosomal protein L6, human

TSL 2

Gene RPL6, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL6-204	ENST00000548343		Q8IZM0	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343		A0A1B0GVY2	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343		H0Y8G0	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	CXCL5	P42830	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	KRTDAP	P60985	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL6-204	ENST00000548343	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	RYR3	Q15413	4870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	LECT2	O14960	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	PRSS2	P07478	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	HERVK_113	P61574	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343		E9PLD3	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	NDUFA1	O15239	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SLPI	P03973	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	GCSH	P23434	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	CKS1B	P61024	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	LEPROT	O15243	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	PCP4	P48539	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	NMU	P48645	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	HERV-K104	P63124	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343		Q6ZRU5	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343		J3QQQ9	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	COX17	Q14061	63 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	STPG4	Q8N801	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL6-204	ENST00000548343	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343		Q6ZSA8	131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	TIMM17B	O60830	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343		Q6ZRP5	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	DLEU1	O43261	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343		A0A096LNI7	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343		A0A0J9YXY3	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPL6-204	ENST00000548343	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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