RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TENM3Q9P273 2699 aa11.46□□□□□ -0.57
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TOM1-216ENST00000492723 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.45□□□□□ -0.58
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TOM1-216ENST00000492723 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.29□□□□□ -0.6
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TOM1-216ENST00000492723 M0QXV9 152 aa11.28□□□□□ -0.6
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TOM1-216ENST00000492723 CARD19Q96LW7 228 aa11.27□□□□□ -0.6
TOM1-216ENST00000492723 C10orf25Q5T742 122 aa11.27□□□□□ -0.61
TOM1-216ENST00000492723 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.27□□□□□ -0.61
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TOM1-216ENST00000492723 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.25□□□□□ -0.61
TOM1-216ENST00000492723 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.25□□□□□ -0.61
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TOM1-216ENST00000492723 TRACP01848 142 aa11.19□□□□□ -0.62
TOM1-216ENST00000492723 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.18□□□□□ -0.62
TOM1-216ENST00000492723 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.18□□□□□ -0.62
TOM1-216ENST00000492723 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TOM1-216ENST00000492723 Q8NDZ9 215 aa11.17□□□□□ -0.62
TOM1-216ENST00000492723 CDIP1Q9H305 208 aa11.17□□□□□ -0.62
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