RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486425.1

MUC4-222, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 4

Gene MUC4, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-222	ENST00000486425	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	CEND1	Q8N111	149 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425		A0A1B0GWB2	263 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	SS18	Q15532	418 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425		Q6ZVH6	145 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	LITAF	Q99732	161 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MUC4-222	ENST00000486425	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		A0A0J9YXY3	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		A6NDN8	102 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	TMEM262	E9PQX1	116 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	HERV-K104	P63124	156 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	REG3A	Q06141	175 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	FXYD2	P54710	66 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	ESRG	Q1W209	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		Q8IZM0	81 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	TAX1BP3	O14907	124 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	BATF	Q16520	125 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	MIA	Q16674	131 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	COX7B2	Q8TF08	81 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		K7EP13	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	IFITM1	P13164	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	CXCL5	P42830	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		Q9H8V8	135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		A0A1B0GV90	55 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	COX7A2L	O14548	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	XCL1	P47992	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425		A0A0B4J2C4	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	CRP	P02741	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	RYR1	P21817	5038 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-222	ENST00000486425	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	APOM	O95445	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	CCL18	P55774	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425		F8WDY8	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	COX17	Q14061	63 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425		A4D1N5	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	IGLL5	B9A064	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	CFC1	P0CG37	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	PRSS2	P07478	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	MAL	P21145	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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