RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 Q9H8V8 135 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 PRR34Q9NV39 138 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 COX7B2Q8TF08 81 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 K7EIL1 84 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 APOMO95445 188 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 FOXI1Q12951 378 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 Q8IZM0 81 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 M0QXV9 152 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 TCL1BO95988 128 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZTC4 211 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf38Q86SI9 138 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 DAND5Q8N907 189 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 F8W1H4 67 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 H3BMG7 143 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 TRIAP1O43715 76 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV2D-28P01615 120 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 REG3AQ06141 175 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 WFDC2Q14508 124 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 SS18Q15532 418 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 SFTA2Q6UW10 78 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 ENHOQ6UWT2 76 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 ERG28Q9UKR5 140 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YWU9 116 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS2P07478 247 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 XCL1P47992 114 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 CCL18P55774 89 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM262E9PQX1 116 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 COX7A2LO14548 114 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 HTN3P15516 51 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 ESRGQ1W209 222 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 COPS9Q8WXC6 57 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA25Q9BR10 227 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LST1O00453 97 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL5P42830 114 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 NPC2P61916 151 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf82Q6UX34 121 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 TENM2Q9NT68 2774 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0U1RRA0 63 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 K7ERU9 68 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB2P49721 201 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 COX17Q14061 63 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 ETDBQ3ZM63 59 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01620Q4KN68 170 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf25Q5T742 122 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 MTURNQ8N3F0 131 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 Q8NDZ9 215 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 MUC7Q8TAX7 377 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 CARD19Q96LW7 228 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 KLK12Q9UKR0 248 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-210ENST00000462363 FBN3Q75N90 2809 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms