RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 ATOX1O00244 68 aa7.58□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.58□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 CELA1Q9UNI1 258 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 C5orf47Q569G3 176 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 C5orf42Q9H799 3197 aa7.57□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 COX17Q14061 63 aa7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 UPK3BQ9BT76 320 aa7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 LINC00643Q86TS7 51 aa7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 LINC00310P59036 64 aa7.55□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.55□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.54□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 PTPRBP23467 1997 aa7.54□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 TMEM258P61165 79 aa7.53□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 ENHOQ6UWT2 76 aa7.53□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 COL4A2P08572 1712 aa7.53□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.53□□□□□ -1.2
TMX3-201ENST00000299608 LAMA3Q16787 3333 aa7.52□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.52□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 A0A1B0GUV1 79 aa7.52□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 AMELXQ99217 191 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 LST1O00453 97 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 MUC7Q8TAX7 377 aa7.51□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 CASC2Q6XLA1 102 aa7.5□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 MDFIQ99750 246 aa7.5□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.5□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 ESRGQ1W209 222 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 C1orf137Q5JT78 98 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 STAB1Q9NY15 2570 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 A0A096LNJ9 63 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 C20orf197Q8N268 126 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.49□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.48□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 Q6ZRU5 148 aa7.48□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 AKAP13Q12802 2813 aa7.48□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 REG3GQ6UW15 175 aa7.48□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 MT-ATP8P03928 68 aa7.47□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 FSHBP01225 129 aa7.47□□□□□ -1.21
TMX3-201ENST00000299608 Q9UF83 564 aa7.46□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 X6R8D5 127 aa7.46□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 C10orf25Q5T742 122 aa7.46□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 PCSK5Q92824 1860 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 C2orf48Q96LS8 159 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 A8MTW9 85 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 HTTP42858 3142 aa7.45□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 BRCA2P51587 3418 aa7.44□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 SEC61GP60059 68 aa7.43□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.43□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 LINC00315P59091 139 aa7.42□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 PRLHP81277 87 aa7.42□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 ZNF292O60281 2723 aa7.42□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 Q8N814 137 aa7.42□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 MGAQ8IWI9 3026 aa7.42□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.41□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.4□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 A0A087WYN8 130 aa7.4□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.4□□□□□ -1.22
TMX3-201ENST00000299608 Q8N3U1 123 aa7.4□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 Q9BRP9 147 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 PRR4Q16378 134 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 C22orf24Q9Y442 160 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 COL6A5A8TX70 2615 aa7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 Q8NAQ8 132 aa7.38□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.38□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.38□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 F8WDY8 70 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 A0A087WSZ3 146 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 NDUFC2O95298 119 aa7.37□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 A0A096LNT2 108 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 CFAP54Q96N23 3096 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 TRIOO75962 3097 aa7.36□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.35□□□□□ -1.23
TMX3-201ENST00000299608 PRYO14603 147 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 290.8 ms