RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAST4O15021 2626 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEFB4AO15263 64 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEC61GP60059 68 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 IMUPQ9GZP8 106 aa14.82□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEFB135Q30KP9 77 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM243Q9BU79 118 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATOX1O00244 68 aa14.81□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A0J9YXY3 114 aa14.8□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.8□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 LST1O00453 97 aa14.79□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM258P61165 79 aa14.79□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.79□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 COX6A2Q02221 97 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 Q9HAA7 133 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 FHL2Q14192 279 aa14.77□□□□□ -0.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A096LPF7 62 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TIRAPP58753 221 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRK1Q8WUW1 75 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRO0628Q9UI54 55 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 MALP21145 153 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 BAALC-AS2P0C853 105 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 F8WDY8 70 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 X6R8D5 127 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACYP1P07311 99 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 GYPEP15421 78 aa14.73□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERP2Q8N6R1 65 aa14.71□□□□□ -0.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 C20orf197Q8N268 126 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 C5orf38Q86SI9 138 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 STAB1Q9NY15 2570 aa14.7□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP5G1P05496 136 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOC4P55056 127 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 Q9H8V8 135 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 V9GYY9 64 aa14.69□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP17L23D6RBM5 183 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 C14orf132Q9NPU4 83 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAL4O96015 105 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTN3P15516 51 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 PAX4O43316 350 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRO0255Q9UI72 69 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 DAD1P61803 113 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 COL6A5A8TX70 2615 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 LITAFQ99732 161 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 C1orf195Q5TG92 126 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 UPK3BQ9BT76 320 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDUFA1O15239 70 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 CXCL5P42830 114 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIAQ16674 131 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 LYRM9A8MSI8 78 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 GHRHP01286 108 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 LINC00846Q9NV44 126 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 CELA1Q9UNI1 258 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPANXCQ9NY87 97 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 XCL1P47992 114 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 MPLKIPQ8TAP9 179 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNURFQ9Y675 71 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 SS18Q15532 418 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 LINC01600Q96MT4 127 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 COX7A2LO14548 114 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIFP14174 115 aa14.52□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.52□□□□□ -0.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 Q8NAQ8 132 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98 ms