RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916		E9PLD3	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	IGLL5	B9A064	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	DLEU1	O43261	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	NMU	P48645	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PVT1-222	ENST00000613916	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	HERVK_113	P63121	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	SEC11A	P67812	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LEPROT	O15243	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LY6G6C	O95867	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	HERVK_113	P61574	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	REG3A	Q06141	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916		J3QQQ9	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	CCL25	O15444	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916		A0A087WZ39	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916		H3BRM9	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	SIVA1	O15304	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	CTAG1A	P78358	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	SS18	Q15532	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	XCL1	P47992	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	CCL18	P55774	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	FOXI1	Q12951	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	HERC1	Q15751	4861 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PVT1-222	ENST00000613916	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	EREG	O14944	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	MIA	Q16674	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0J9YXY3	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	COX7A2L	O14548	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFA1	O15239	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	CRP	P02741	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916		Q9H8V8	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916		M0R143	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-222	ENST00000613916	HSD52	Q0P140	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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