RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613049.4

RGS3-231, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGS3, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-231	ENST00000613049	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	C9orf118	A6NHY6	69 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM262	E9PQX1	116 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049		A0A0J9YXY3	114 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM238	C9JI98	176 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	RBX1	P62877	108 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	VAMP3	Q15836	100 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	NOTCH1	P46531	2555 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV3-30	P01768	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	RAB37	Q96AX2	223 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049		A0A1B0GWB2	263 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049		K7ERJ3	54 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	NDUFA1	O15239	70 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049		H3BNG1	76 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	LELP1	Q5T871	98 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RGS3-231	ENST00000613049	UBE2V1	Q13404	147 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		H3BUT2	72 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		A0A0J9YWU9	116 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	CCL25	O15444	150 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	TIMM17B	O60830	172 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	SS18	Q15532	418 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		Q6ZTC4	211 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	LITAF	Q99732	161 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		K7EIL1	84 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	SPANXC	Q9NY87	97 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		A0A1W2PPM0	123 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		Q9H8V8	135 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049		A0A087WZ39	114 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RGS3-231	ENST00000613049	IGLL5	B9A064	214 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	FABP2	P12104	132 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	HERV-K104	P63124	156 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	MIA	Q16674	131 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	COX7B2	Q8TF08	81 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	GAGE10	A6NGK3	116 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	APOM	O95445	188 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	XCL1	P47992	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049		A4D1N5	150 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	REG3A	Q06141	175 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049		K7EP34	96 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	PRSS2	P07478	247 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	CFC1B	P0CG36	223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	CFC1	P0CG37	223 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	IFITM1	P13164	125 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	C5orf38	Q86SI9	138 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049		Q8N3U1	123 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RGS3-231	ENST00000613049		A0A0B4J2C4	111 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	SFTA2	Q6UW10	78 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	MRAP	Q8TCY5	172 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	COPS9	Q8WXC6	57 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	TSPAN13	O95857	204 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	PRR34	Q9NV39	138 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	COX7A2L	O14548	114 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049		Q8IZM0	81 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	DAND5	Q8N907	189 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	KLK12	Q9UKR0	248 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RGS3-231	ENST00000613049	NPC2	P61916	151 aa		12.71	□□□□□ -0.38
RGS3-231	ENST00000613049	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		12.71	□□□□□ -0.38
RGS3-231	ENST00000613049	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RGS3-231	ENST00000613049	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
RGS3-231	ENST00000613049	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RGS3-231	ENST00000613049		A0A0U1RRA0	63 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RGS3-231	ENST00000613049	ESRG	Q1W209	222 aa		12.69	□□□□□ -0.38

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