RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ENHOQ6UWT2 76 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf126Q8N4M7 172 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 Q9H8V8 135 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFAND6Q6FIF0 208 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CSMD3Q7Z407 3707 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CD164L2Q6UWJ8 174 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2WQ96B02 151 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-206ENST00000588815 NMUP48645 174 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01561Q8N1V8 128 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WZ39 114 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 COX8AP10176 69 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 XCL1P47992 114 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PRO1933Q9H354 126 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TGP01266 2768 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 LEPROTO15243 131 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHB2Q96CS7 222 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCR10Q9UDW1 63 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C14orf144Q96I85 54 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINK8P0C7L1 97 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM1B2RUZ4 78 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 DLEU1O43261 78 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A34Q6PIV7 304 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa20.88■□□□□ 0.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 MIEN1Q9BRT3 115 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QQQ9 107 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 COX7A2LO14548 114 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf43Q9BWL3 253 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXI1Q12951 378 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf38Q86SI9 138 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PCP2Q8IVA1 136 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE12HA6NDE8 117 aa20.83■□□□□ 0.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 STARD9Q9P2P6 4700 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC32Q5I0X7 151 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CASC10Q5T4H9 136 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TENM2Q9NT68 2774 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 APOMO95445 188 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MALP21145 153 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPEAR-AS2P59090 65 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-206ENST00000588815 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA12Q9UI09 145 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-206ENST00000588815 PCP4L1A6NKN8 68 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SFTA2Q6UW10 78 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8IZM0 81 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-206ENST00000588815 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-206ENST00000588815 TM2D2Q9BX73 214 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS2P07478 247 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 ORAOV1Q8WV07 137 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM7Q9P0U1 55 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TP73-AS1Q9UF72 201 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB1D4Q6XE38 83 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf91Q6ZV80 131 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL5P42830 114 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 HERV-K104P63124 156 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf226Q5I0X4 101 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP161Q6P656 301 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0087Q14695 138 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00476Q8WZB0 136 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0J9YXY3 114 aa20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 CKS1BP61024 79 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf56Q8N910 161 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAH1Q9P2D7 4330 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00587B1AMM8 73 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 F8WDY8 70 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM17BO60830 172 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6G6CO95867 125 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CTAG1AP78358 180 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM238C9JI98 176 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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