RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	PRSS47	A8MTI9	375 aa		11.82	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	CCL25	O15444	150 aa		11.82	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	XCL1	P47992	114 aa		11.82	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.82	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	MT-ND6	P03923	174 aa		11.81	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.81	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390		Q8N8P6	123 aa		11.81	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		11.81	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.81	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	LRP2	P98164	4655 aa		11.8	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.8	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		11.8	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.8	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.79	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.79	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	SS18	Q15532	418 aa		11.78	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390		Q6ZUT4	128 aa		11.78	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.78	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		11.78	□□□□□ -0.52
P4HB-223	ENST00000576390	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390		A0A0J9YXV3	536 aa		11.76	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	SYCN	Q0VAF6	134 aa		11.76	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		11.76	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.76	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP10-8	P60410	259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		11.75	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		11.75	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		11.74	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.74	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.73	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390		K7EMI3	77 aa		11.73	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	ODF1	Q14990	250 aa		11.73	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.73	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.73	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390		Q6ZRP5	223 aa		11.72	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	RNF213	Q63HN8	5207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.71	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.71	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.71	□□□□□ -0.53
P4HB-223	ENST00000576390	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.7	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	FA2H	Q7L5A8	372 aa		11.7	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.7	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.7	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.68	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.68	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	COX7A2L	O14548	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	G0S2	P27469	103 aa		11.68	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.68	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390		A0A1W2PNN7	141 aa		11.67	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	MAL	P21145	153 aa		11.67	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.67	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.67	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390		Q6ZN92	141 aa		11.66	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		11.66	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	APOM	O95445	188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.65	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.65	□□□□□ -0.54
P4HB-223	ENST00000576390	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.64	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.64	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.63	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.63	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	VCX2	Q9H322	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	NPS	P0C0P6	89 aa		11.61	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00614	P0C842	121 aa		11.61	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.61	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.61	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	AMELX	Q99217	191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		11.61	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	RAB5B	P61020	215 aa		11.6	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.6	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.6	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.6	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.6	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.59	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	SCO1	O75880	301 aa		11.59	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	TRGC2	P03986	189 aa		11.59	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	UBE2D1	P51668	147 aa		11.59	□□□□□ -0.55
P4HB-223	ENST00000576390	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		11.58	□□□□□ -0.56
P4HB-223	ENST00000576390	S100A1	P23297	94 aa		11.58	□□□□□ -0.56
P4HB-223	ENST00000576390	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.58	□□□□□ -0.56
P4HB-223	ENST00000576390	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56

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