RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AMELXQ99217 191 aa8.4□□□□□ -1.06
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VCX2Q9H322 139 aa8.4□□□□□ -1.06
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCO1O75880 301 aa8.39□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.39□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPG2P98160 4391 aa8.38□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MALP21145 153 aa8.38□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE2D1P51668 147 aa8.38□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.38□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A096LNJ9 63 aa8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HBDP02042 147 aa8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APOMO95445 188 aa8.36□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.36□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C5orf38Q86SI9 138 aa8.36□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 S100A1P23297 94 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SEC11AP67812 179 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PMCHL1Q16048 86 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC01620Q4KN68 170 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAGE3Q86Y29 109 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.35□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A087WZ39 114 aa8.34□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.34□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLPIP03973 132 aa8.34□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.34□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6ZSA8 131 aa8.34□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.34□□□□□ -1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP6V1G1O75348 118 aa8.33□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HERVK_113P63121 156 aa8.33□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COX6A2Q02221 97 aa8.33□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PMVKQ15126 192 aa8.33□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.32□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSBP1O75506 76 aa8.32□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP5LO75964 103 aa8.32□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.32□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CST9LQ9H4G1 147 aa8.32□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 XGP55808 180 aa8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPAG11BQ08648 103 aa8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C2orf48Q96LS8 159 aa8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.31□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.3□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0J9YXV3 536 aa8.3□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.3□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SERF1AO75920 110 aa8.3□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.3□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CARD19Q96LW7 228 aa8.3□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F8WDY8 70 aa8.29□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00310P59036 64 aa8.29□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYCNQ0VAF6 134 aa8.29□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.29□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.29□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BKO60814 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BJP06899 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BOP23527 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BBP33778 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFA6P56556 154 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BDP58876 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BCP62807 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.28□□□□□ -1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLC3P0DOY3 106 aa8.27□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.27□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.27□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.27□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFA1O15239 70 aa8.26□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA0087Q14695 138 aa8.26□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCE2CQ5TA81 110 aa8.26□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6ZRU5 148 aa8.26□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCXQ7RTU7 201 aa8.26□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.26□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.25□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HAMPP81172 84 aa8.25□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF151Q2KHN1 245 aa8.25□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.24□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H3BRM9 83 aa8.24□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUPR1O60356 82 aa8.24□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LEPROTL1O95214 131 aa8.24□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRSS2P07478 247 aa8.24□□□□□ -1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q8IZM0 81 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms