RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB14P61106 215 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0J9YXV3 536 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PNN7 141 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 IFITM10A6NMD0 228 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 APOMO95445 188 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MT-ND4LP03901 98 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 PRSS47A8MTI9 375 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB5AP20339 215 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 CLLU1Q5K131 121 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.86□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCYAP1P18509 176 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 C10orf25Q5T742 122 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-204ENST00000528201 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF151Q2KHN1 245 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 Q8N8P6 123 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 IFITM2Q01629 132 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0087Q14695 138 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM141Q96I45 108 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A087WZ39 114 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 UBE2D1P51668 147 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 Q6ZRP5 223 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 NDUFA1O15239 70 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC01600Q96MT4 127 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM218A2RU14 115 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 F8WDY8 70 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 IGIPA6NJ69 53 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ODF1Q14990 250 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 IMMP2LQ96T52 175 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 AMELXQ99217 191 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM168BA1KXE4 195 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 UQCC3Q6UW78 93 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf82Q6UX34 121 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 VCX2Q9H322 139 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 Q6ZN92 141 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-204ENST00000528201 K7EMI3 77 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 GAGE2EQ4V326 116 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 NPSP0C0P6 89 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 KRTAP10-8P60410 259 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 MT-ND6P03923 174 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 LRP2P98164 4655 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 REG3GQ6UW15 175 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TOMM6Q96B49 74 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 SEC11CQ9BY50 192 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 C1orf137Q5JT78 98 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-204ENST00000528201 COMMD7Q86VX2 200 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 TIMM17AQ99595 171 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC01546A6NGU7 62 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 HERVK_113P63121 156 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ERASQ7Z444 233 aa14.59□□□□□ -0.07
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