RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 K7EQZ3 153 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 NALCNQ8IZF0 1738 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 GNG11P61952 73 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 F6UZH7 168 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 CORTO00230 105 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBE2D3P61077 147 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBE2D2P62837 147 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATRQ13535 2644 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 TET3O43151 1660 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-677P-201ENST00000516914 SCAPERQ9BY12 1400 aa-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 CUL7Q14999 1698 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 GNG4P50150 75 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 Q0VG73 95 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZANQ9Y493 2812 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 BTAF1O14981 1849 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP3R1P63098 170 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 MANBALQ9NQG1 85 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 SVBPQ8N300 66 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 MUC2Q02817 5179 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADGRL2O95490 1459 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 APC2O95996 2303 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPRR2BP35325 72 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPTA1P02549 2419 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 COX6CP09669 75 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 LCN9Q8WX39 176 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSC2P49815 1807 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM223BA6NKX1 122 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 H3BQ15 152 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 S100A1P23297 94 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-677P-201ENST00000516914 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A1B0GWA3 101 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 GNG8Q9UK08 70 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 PZPP20742 1482 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPINK4O60575 86 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM203Q969S6 136 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRO1933Q9H354 126 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 COL6A3P12111 3177 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 C12orf57Q99622 126 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SNCAP37840 140 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 TCHHQ07283 1943 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 SCN7AQ01118 1682 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 KIAA0556O60303 1618 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms