RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	PIEZO1	Q92508	2521 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-212	ENST00000515746	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	POLQ	O75417	2590 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	HTN1	P15515	57 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	HERV-K104	P63124	156 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6YL49	198 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf38	Q86SI9	138 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		Q96MF0	132 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	PEMT	Q9UBM1	199 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	SORL1	Q92673	2214 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFA7	O95182	113 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP10-2	P60368	255 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB136	Q30KP8	78 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPE	Q02224	2701 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRK2	Q5S007	2527 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	ACACB	O00763	2458 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EQD1	137 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5G1	P05496	136 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CXCL5	P42830	114 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN13	Q12923	2485 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	COL12A1	Q99715	3063 aa		3.5	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0U1RRA0	63 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZTI0	123 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	COX7B2	Q8TF08	81 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	NRGN	Q92686	78 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	FBN2	P35556	2912 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	UQCRQ	O14949	82 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CRP	P02741	224 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL18	P55774	89 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	JMJD1C	Q15652	2540 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	CHD6	Q8TD26	2715 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087WYN8	130 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087WZ39	114 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	LY6G6D	O95868	133 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6JHZ5	121 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM86B	Q8N661	226 aa		3.47	□□□□□ -1.85
ATXN3-212	ENST00000515746	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.47	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms