RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	hDV102S1	A0JD36	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MAL	P21145	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXI1	Q12951	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	COX7A2L	O14548	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01620	Q4KN68	170 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	HERC1	Q15751	4861 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	APOM	O95445	188 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGC2	P03986	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A1	P23297	94 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC11A	P67812	179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	COLCA2	A8K830	154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	HBD	P02042	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	AMELX	Q99217	191 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf56	Q8N910	161 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SCO1	O75880	301 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5L	O75964	103 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2D1	P51668	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	HSBP1	O75506	76 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA6	P56556	154 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	HERVK_113	P63121	156 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PMVK	Q15126	192 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.07	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.06	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WZ39	114 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	OXT	P01178	125 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SLPI	P03973	132 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		11.05	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424		F8WDY8	70 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.04	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424		J3QL48	77 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	COX6A2	Q02221	97 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCN	Q0VAF6	134 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.03	□□□□□ -0.64
HDAC10-216	ENST00000489424	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1G1	O75348	118 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS2	P07478	247 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		11.02	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A096LNJ9	63 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0J9YXV3	536 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	DPH3	Q96FX2	82 aa		11.01	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		11	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		11	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BRM9	83 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	PANO1	I0J062	215 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	SERF1A	O75920	110 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		10.99	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA1	O15239	70 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.98	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WYN8	130 aa		10.97	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.97	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		10.97	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		10.97	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	CKS1B	P61024	79 aa		10.96	□□□□□ -0.65

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