RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.47□□□□□ -1.05
CENPF-202ENST00000464322 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CENPF-202ENST00000464322 F8WDY8 70 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZUT4 128 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 TMEM18Q96B42 140 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 KIR2DL4Q99706 377 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 CDIP1Q9H305 208 aa8.46□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.45□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 HMSDA8MTL9 139 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 ZNF861PO60384 105 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 RAB4AP20338 218 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.44□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 SMKR1H3BMG3 65 aa8.43□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 AMN1Q8IY45 258 aa8.43□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.43□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 A0A1B0GUT8 65 aa8.42□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.42□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.42□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 PPP1R17O96001 155 aa8.41□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.4□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 CRYGAP11844 174 aa8.4□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.4□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.4□□□□□ -1.06
CENPF-202ENST00000464322 HIGD1CA8MV81 97 aa8.39□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 CEBPGP53567 150 aa8.39□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 IFITM10A6NMD0 228 aa8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 PPP1R2P9O14990 202 aa8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 HBBP68871 147 aa8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.38□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 A0A087X002 238 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 NUPR1O60356 82 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 RIGQ13278 110 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 CT83Q5H943 113 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 C2orf82Q6UX34 121 aa8.37□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 RGS21Q2M5E4 152 aa8.36□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 NRACQ8N912 160 aa8.36□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.35□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.35□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 C22orf24Q9Y442 160 aa8.35□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.34□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 KIAA0087Q14695 138 aa8.34□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.34□□□□□ -1.07
CENPF-202ENST00000464322 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 TCAPO15273 167 aa8.33□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 ZNF727A8MUV8 499 aa8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 TMEM250H0YL14 139 aa8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 PRSS2P07478 247 aa8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 C20orf78Q9BR46 151 aa8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.32□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 CKS2P33552 79 aa8.31□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.31□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.31□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 FAM104AQ969W3 186 aa8.31□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.31□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 BCE1O60756 84 aa8.3□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 CKS1BP61024 79 aa8.3□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 TPRXLQ17RH7 258 aa8.3□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.3□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.3□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 LINC00862A6NCI5 91 aa8.29□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.29□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.29□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 OSTCQ9NRP0 149 aa8.29□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 MUC17Q685J3 4493 aa8.29□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 TNFRSF6BO95407 300 aa8.28□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.28□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 BATF3Q9NR55 127 aa8.28□□□□□ -1.08
CENPF-202ENST00000464322 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 RAB5AP20339 215 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 UBE2AP49459 152 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 LINC01551Q86U37 167 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 SLC51BQ86UW2 128 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.27□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.26□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.26□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.26□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 GAGE10A6NGK3 116 aa8.25□□□□□ -1.09
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZN92 141 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms