RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM126AQ9H061 195 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6Q795 121 aa7.27□□□□□ -1.24
RABGEF1-205ENST00000450873 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.27□□□□□ -1.24
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.27□□□□□ -1.24
RABGEF1-205ENST00000450873 Q9H8V8 135 aa7.27□□□□□ -1.24
RABGEF1-205ENST00000450873 LELP1Q5T871 98 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 AMN1Q8IY45 258 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF185Q96GF1 192 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WX48 190 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5LO75964 103 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 GAGE2EQ4V326 116 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC32Q5I0X7 151 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R17O96001 155 aa7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 K7ERJ3 54 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKCP01834 107 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 FCER1GP30273 86 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 TEN1Q86WV5 123 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 NPYP01303 97 aa7.23□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 M0R2N4 97 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 DPM2O94777 84 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 SPANXCQ9NY87 97 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 SNCGO76070 127 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZR54 194 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 SMKR1H3BMG3 65 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-205ENST00000450873 GAS8-AS1O95177 125 aa7.21□□□□□ -1.25
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RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GVY2 172 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 NFE4Q86UQ8 179 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 NRACQ8N912 160 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-205ENST00000450873 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC179H3BU77 68 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 I3L3M4 83 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 M0QXV9 152 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFRSF6BO95407 300 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM243Q9BU79 118 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAH2Q9P225 4427 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-30P01768 117 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-33P01772 117 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.18□□□□□ -1.26
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RABGEF1-205ENST00000450873 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8N8P6 123 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 RTL8CO15255 209 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H4GQ99525 98 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf223Q8N319 242 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DL4Q99706 377 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 CARD19Q96LW7 228 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2L6O14933 153 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TSHBP01222 138 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.16□□□□□ -1.26
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